荷花栽培品种很多，依用途不同可分为藕莲、子莲和花莲三大系统。根据《中国荷花品种图志》的分类标准共分为3系、50群、23类及28组。

中国莲系

I.大中花群:a.单瓣类：1.单瓣红莲组 2.单瓣粉莲组 3.单瓣白莲组

b.复瓣类：4.复瓣粉莲组

c.重瓣类：5.重瓣红莲组 6.重瓣粉莲组 7.重瓣白莲组 8.重瓣洒锦组

d.重台类：9.红台莲组

e.千瓣类：10.千瓣莲组

II. 小花群：

f.单瓣类：11.单瓣红碗莲组 12.单瓣粉碗莲组 13.单瓣白碗莲组

g.复瓣类：14.复瓣红碗莲组 15.复瓣粉碗莲组 16.复瓣白碗莲组

h.重瓣类：17.重瓣红碗莲组 18.重瓣粉碗莲组 19.重瓣白碗莲组。

美国莲系

III.大中花群：

i.单瓣类：20.单瓣黄莲组

中美杂种莲系

IV.大中花群：

盛开的荷花

j.单瓣类：21.杂种单瓣红莲组 22.杂种单瓣粉莲组 23.杂种单瓣黄莲组 24.杂种单瓣复色莲组

k.复瓣类：25.杂种复瓣白莲组 26.杂种复瓣黄莲组

V.小花群：

l.单瓣类： 27.杂种单瓣黄碗莲组

m.复瓣类：28.杂种复瓣白碗莲组