黑三棱科仅包括1属—黑三棱属（SparganiumL.）约20余种，分布在北温带和澳大利亚，中国有约6种，分布在东北到西南一带。本科植物为水生植物，生长在沼泽地带和湖泊边缘浅水处，有根茎和茎；叶狭长，无柄，直立或浮水；花单性，雌雄同株，每一花序上，雄花束生于雌花束之上，花被由延长的鳞片组成；果实的外果皮为海绵质。

1981年的克朗奎斯特分类法将其列入香蒲目，1998年根据基因亲缘关系分类的APG分类法将起放在新设立的禾本目内。