肝脏的生理功能极为复杂，因此肝功能检查种类繁多，医生常选择几种有代表性的肝功能项目来了解肝功能，如蛋白质代谢功能试验（血清蛋白电泳、白蛋白/球蛋白比例）、胆红素代谢功能试验（包括血液总胆红素和直接胆红素、尿胆原和尿胆红素）、肝脏染料排泄试验以及各种血清酶检查。

但是肝功能检查也不是万能的，有一定局限性。首先肝功能检查的敏感程度有一定限度，而且肝脏代偿储备能力很强，因此肝功能检查正常不一定没有肝病，另外，肝功能检查中的有些指标缺乏特异性，所以肝功能异常也不一定就是肝病。此外，血清酶的活性是一项很重要的评判标准，但它不反映肝脏功能，酶的指标只是对肝细胞完整性的估计。总之，肝功能检查只能作为诊断肝胆系统疾病的一种辅助手段；要对疾病作出正确诊断，还必须结合病史、体格检查及影象学检查等，全面地综合分析。