吴茱萸始载于《本经》，列入中品。宋代《本草图经》记载：“今处处有之，江、浙、蜀、汉尤多。木高丈余，皮青绿色，叶似椿而阔厚，紫色，三月开花，红紫色。七月八月结实，似椒子，嫩时微黄，至成熟时则深紫。”据江西省药物研究所调查，现今吴茱萸的产地及形态与上述引文基本符合，只是花是白色，与文献所载花红紫色不同。《本草图经》还附有两幅插图，一幅是临江郡吴茱萸，临江郡为现江西省清江，图中叶片两两对生，伞形花序腋生，与山茱萸科植物山茱萸 Cornus officinalis Sieb. et Zucc. 相似，而非芸香科吴茱萸。另一幅是越州吴茱萸，越州即现浙江省绍兴，从图中看出，叶为奇数羽状复叶，对生，小叶5～7片，椭圆形，小叶片相互疏离，小花密集成聚伞状的圆锥花序，与芸香科植物石虎 Evodia rutaecarpa （Juss.）Benth. var. officinalis （Dode）Huang相似。明代《纲目》记载：“茱萸枝柔而肥，叶长而皱，其实结于梢头，累累成簇而无核，与椒不同。一种粒大，一种粒小，小者入药为胜。”按粒大的可能指吴茱萸，粒小的可能指石虎。与现今商品两种等级相符。 食茱萸，最早是唐《新修本草》记载：“味辛苦，大热，无毒，功用与吴茱萸同，少为劣耳，疗水气，用之乃佳。”指出吴茱萸和食茱萸功效相类同。宋《本草图经》记载：“食茱萸，旧不载所出州土。云功用与吴茱萸同，或云即茱萸中颗粒大，经久色黄黑，堪啖者是。今南北皆有之。其木亦茂高大，有长及百尺者，枝茎青黄，上有小白点，叶正类油麻。花黄。”并附有蜀州食茱萸插图。蜀州即今四川重庆。从图中羽状复叶的小叶彼此靠拢，又花朵密集，结合描述，经鉴定即为芸香科植物吴茱萸 Evodia rutaecarpa（Juss.）Benth.。