环境变化对微生物的影响主要是通过改变其生存条件，从而导致微生物发生适应性变异。这些变化可以是物理性的，如温度、pH值的变化；化学性的，比如营养物质的可用性和抗生素的存在；以及生物性的，例如竞争物种或捕食者的存在。以下是几种主要的方式：
1. 温度：温度升高或降低可能促使微生物产生新的酶或者改变其现有的代谢途径以适应新环境。极端条件下，一些微生物可能会发展出休眠状态（如形成孢子）来抵抗不利条件。
2. pH值：不同的微生物对pH值有不同的耐受范围。当环境的酸碱度超出某类微生物的最佳生长区间时，它们可能通过改变细胞膜结构或产生缓冲物质等方式来进行适应。
3. 营养压力：在营养丰富的环境中，微生物能够快速繁殖；而在资源稀缺的情况下，则需要更有效地利用有限的营养物。这可能导致某些菌株进化出特殊的代谢途径或者增强其吸收特定营养的能力。
4. 抗生素和其他化学物质：长期暴露于低浓度抗生素下可以促使细菌产生抗药性突变。此外，其他有毒化学品也可能诱导微生物基因组发生改变以提高生存能力。
5. 生物因素：与其他生物的相互作用也会促进微生物变异。例如，在与病毒共存的过程中，某些细菌可能会获得新的遗传物质；而在竞争食物资源时，则可能发展出更强的竞争策略。
总之，环境变化为微生物提供了选择压力，推动了其适应性进化的进程。这种进化不仅体现在个体水平上的表型改变上，还涉及到群体层面的生态位调整和多样性增加等方面。