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蛔虫有钻孔习性，喜碱性环境。驱蛔不当、发热、胃肠道功能紊乱等原因，使寄生在小肠中下段的蛔虫因寄生环境改变或受到刺激而向上窜动，可经十二指肠乳头钻入胆道，Oddi 括约肌受到刺激而发生强烈痉挛，导致上腹部阵发性剧烈绞痛；蛔虫将肠道细菌带入胆道，可引起胆管炎症，甚至细菌性肝脓肿；如果蛔虫阻塞胰管开口，可引起急性胰腺炎；蛔虫可经胆囊管钻入胆囊，引起胆囊穿孔；还可损伤胆道黏膜，引起胆道出血；蛔虫的虫体或虫卵均可作为核心，引起胆道结石。

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