1、不孕

阴道毛滴虫能吞噬精子，并能阻碍乳酸生成，影响精子在阴道内存活，因此可并发不孕症。

2、不良妊娠结局

妊娠后期由于阴道防御能力下降而发生细菌性混合感染，使症状加重。可造成不良的妊娠结局，如胎膜早破、早产、低出生体重儿。

3、其他性病

滴虫性阴道炎患者得艾滋病等其他性病的风险增加。

4、其他炎症

若并发尿道感染，可有尿频、尿痛的症状，有时可有血尿。部分患者可并发尿道旁腺或前庭大腺感染，盆腔炎性疾病及盆腔疼痛等不适。