1、完全性横隔

两者均有原发性闭经伴周期性腹痛，并呈进行性加剧。可通过超声及MRI检查相鉴别。

2、先天性宫颈闭锁

临床上罕见，患者子宫内膜有功能时，青春期后可因宫腔积血而出现周期性腹痛。经血还可经输卵管逆流入腹腔，引起盆腔子宫内膜异位症。处女膜有孔，阴道内无积血。

3、阴道闭锁

为泌尿生殖窦未参与形成阴道下段所致。闭锁位于阴道下段，其上多为正常阴道，症状与处女膜闭锁相似，检查时也无阴道开口，但闭锁处黏膜表面色泽正常，亦不向外膨隆，肛查扪及向直肠凸出的阴道积血包块，其位置较处女膜闭锁高。