黄酮类化合物的颜色与其结构密切相关，具体来说：

1.母核结构：黄酮类化合物的基本骨架是C6-C3-C6，其中两个苯环（A环和B环）通过一个三碳链相连。不同的黄酮类化合物在这些环上的取代基不同，这会影响其颜色。

2.取代基：黄酮类化合物的颜色受其分子中特定位置的取代基的影响。例如：

- 羟基（-OH）：在3位、5位和7位的羟基可以增强黄酮类化合物的黄色。

- 甲氧基（-OCH3）：通常会使颜色变浅，有时会呈现淡黄色或白色。

- 二氢黄酮：由于其结构中存在双键被饱和的情况，颜色通常较浅。

3.pH值：黄酮类化合物的颜色受溶液的酸碱性影响。在不同的pH条件下，黄酮类化合物可以形成不同的离子形式，从而改变其颜色。例如：

- 在酸性条件下，黄酮类化合物可能呈现黄色。

- 在中性和弱碱性条件下，它们可能呈现橙色或红色。

4.共轭系统：黄酮类化合物的共轭系统（即交替的双键和单键）对其吸收光谱有重要影响。较长的共轭系统可以吸收更长波长的光，从而导致颜色的变化。

综上所述，黄酮类化合物的颜色主要受其母核结构、取代基类型及其位置、溶液的pH值以及分子中的共轭系统的影响。