黑龙江中医药大学的学科建设：

截至2014年6月，黑龙江中医药大学具有博士、硕士、学士三级学位授予权，有中医学、中药学、中西医结合3个一级学科覆盖全部16个二级学科博士学位授予权，21个学科具有硕士学位授予权；具有中医学、中药学2个博士后科研流动站医学教|育网搜集整理；有国家级重点学科2个、国家中医药管理局重点学科14个、省级重点学科12个；为国务院学位委员会批准的临床医学博士、硕士专业学位教育试点院校，国家药品临床研究基地，“长江学者奖励计划”设置特聘教授岗位的高等院校之一。

学校设有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，是国家首批第二类特色专业（中医学）建设点和国家第一类特色专业（中药学、药物制剂和针灸推拿学）建设点，是国家首批中药类人才培养模式创新实验区。

国家重点学科：

中药学一级学科、方剂学学科、中医妇学学科、中医内科学学科（培育）。

国家中医药管理局重点学科：

中医基础理论学科、金匮要略学科、中医史学学科、方剂学学科、中医心病学学科、中医血液病学学科、中医老年病学学科、中医内分泌病学学科、中医妇科学学科、中医皮肤病学学科、中医眼科学学科、中西医结合临床学科、中医康复学学科、针灸学学科、推拿学学科、中药鉴定学学科、中医康复学学科、临床中药学学科、中药炮制学科学、中医预防医学学科（培育）、中医药工程学学科（培育）.