选育良种是药用植物栽培中的一项重要措施，多年来人们在长期的生产实践中培育出很多优良品种，例如地黄优良品种金状元、武涉1号、黑英比劣种产量提高1～3倍；北京1号、2号品种，在贫瘠土地栽培，同样可获得高产。薄荷品种海香1号，含薄荷脑量85%以上，江西1号品种含薄荷油2.64%-4.24%，比胜利薄荷含油量高1～4倍。红花、川红1号的产量比普通品种提高1倍等。此外，还选出来不少的优良类型如附子有南瓜叶和丝瓜叶型医|学教育网搜集整理；人参有大马牙、二马牙、长脖和圆膀圆芦型；浙贝母有宽叶型、铁杆型；枸杞有江西1号、浙江2号等。这些优良类型之间的产量和有效成分的含量亦不同。

　　选种的目标应根据需要来确定，例如作为提取效成分为目的的，如金荞麦一叶萩、蛔蒿和洋地黄、颠茄等，应选择成分含量高的品种或类型。作为常用的重要药材，如根茎类的贝母、细辛、黄连、延胡、白术等，应选高产优质的品种；花类药材，如款冬花、金银花等，应选药用部位集中，便于机械化采收的品种。种子、果实类药材，如薏仁、砂仁、山茱萸、使君子、栀子应选果大粒重产量高的品种。生长周期长的药材，人参、三七、西洋参等，应选早熟品种。此外，更应重视选择抗逆性强的品种如抗病虫害、抗寒、抗涝等。选育品种的方法，通常采用杂交和连续的人工选择两种方法。

　　1.杂交分有性杂交和无性杂交，但经常采用的是有性杂交。

　　（1）有性杂交就是采用不同特性的亲本植物进行支配。杂交种子所产生的种子叫杂种，它具有较强的生活力、较优良的性状和容易变异等特征，从杂种中容易选择和培育出人们所需要的优质高产的新品种。

　　（2）无性杂交 是将两个具有不同性状的亲本植物进行嫁接愈合而获得无性杂种。从无性杂种中亦可。选择和培育出优质高产的新品种。

　　2.连续的人工选择是选种工作一项最基本最重要的方法。医|学教育网搜集整理就是采用连续不断地从栽培植物的大田中或杂种后代的试验地里，选择具有优良性状的单株或群体，并用人工的方法加以定向培育，形成优质高产品种。目前药用植物栽培中，如地黄、薄荷等生产上所利用的品种，都是采用连续的人工选择方法培育出来的。