作为央企序列中唯一的医药行业科研院所，上海医工院曾先后隶属中央企业工委、国务院国资委，沪深股市医药板块中有30余家上市公司以其输出的科研成果作为主要产品，2010年目标营收15亿元。

　　在宋志平对国药的设计中，医药研究是国药目前必须重点弥补的一环——“只有医药研究进入，国药才有可能成为中国最大的医药健康平台”。“现在国药80%的利润来自商业，如果能在研发和工业上有进步，那国药的整体实力就不可同日而语了。”采访中，一位接近国药的业内人士告诉《第一财经日报》，由于上海医工院具有很高的市场价值，国药对其非常看重；但另一方面，也正因为自身良好的地位和发展前景，上海医工院方面对重组一事并不热衷。

　　上海医工院2008年销售收入9.1亿，下属两家工业企业：现代制药[15.06 -0.53%] （600420.SH）和上海现代药物制剂工程研究中心有限公司业绩也很好。而上海医工院方面认为，尽管国药“科工贸”一体，但长期以来，一直长于商业，在研发等方面并不具备很大优势。

　　更重要的是，如果重组进入国药，就意味着，上海医工院作为央企一级序列研究机构的身份将不复存在，而必须变为国药集团下属二级子公司。

　　“此外，按照国药目前对自身业务模块的梳理整合趋势，医工院并入国药后，其下属的现代制药是否会被划入国药专门负责工业的集团工业部，也很难预测。”前述人士告诉记者。

　　与之相关联，中国医药集团四川抗菌素工业研究所（下称“川抗所”）划转上海医工院一事也开始浮出水面。作为我国主要的药物研究开发机构之一，川抗所在众多领域的关键技术研究、重大品种产业化方面均处于国内先进水平，仅丁胺卡那一项已累计为国家创造数十亿元产值。