第三磨牙萌出困难是引起冠周炎的主要原因。这种原因的产生是由于磨牙萌出位置不符，这与人类种系发生和演变过程中，由于食物、生活习惯与咀嚼力的变化，逐渐产生下颌骨的退化有关。

　　磨牙阻生的类型对冠周炎的发生也有一定的影响。临床上以部分萌出的垂直阻生和近中倾斜阻生最多，也最常引起冠周炎。萌出不全的牙冠位置大多低于第二磨牙咬平面，其远中和颊、舌侧常有龈瓣覆盖，龈瓣与牙冠之间形成深而窄的盲袋，它自洁作用差，易藏食物残渣，它的温度及湿度是细菌生长繁殖的良好条件。正常情况下，人体抵抗力强，细菌不能得逞。但当人体在感冒，睡眠不足、疲劳等情况使人体低抗力下降，此时细菌繁殖引起感染。

　　咬及咀嚼时对龈瓣的机械损伤，使粘膜发生溃烂，破坏了组织的防御功能，使细菌乘机而入，也可引起冠周炎。