分子网络是分子在细胞内活性展示的骨架。最新研究采用一种比较的方法来解析这些网络结构，即通过比较不同物种、不同分子类型的分子网络（有时甚至是在多样的环境背景中进行比较）。在以下列举的这篇综述中，作者研究了生物网络比较分析这一领域，描绘了它在解析细胞机器方面，以及预测蛋白质功能、相互作用方面的应用。同时，作者还指出了当前该领域存在的问题，医学`教育网搜集整理提出了一些自己的解决方案。一些对序列比较有用的方法和概念上的进展都可能会对网络解析起推动作用，如改良的搜索算法，多序列比对的技术，相似性评分的进化模型，以及对公共数据库的更好的整合，等等。