由于鉴定受血者血清中HLA抗体（多采用微量淋巴细胞毒试验）、抗血小板抗体、抗粒细胞特异性抗体及致热原性细胞因子（多用ELISA法检测）技术性较强，基层医院不易进行，因此，FNHTR的诊断目前通常仍采取排除性诊断法。FNHTR要与细菌污染性输血反应鉴别，二者虽然均有发热，但前者停止输血，经对症处理病情很快缓解，血压多无变化;后者多有高热、休克、皮肤充血三大特征，停止输血并经对症处理无效。当高度怀疑受血者有脓毒血症时，血袋及受血者输血后的留血样需进行血培养。同时必须联合应用大剂量抗生素，积极抗休克治疗，才有望抢救成功。FNHTR与溶血性发热反应也都有发热，但后者与输注的血型及输血量有关，可出现心悸、胸腰背痛、呼吸困难、心率加快、血压下降、酱油色样尿，甚至发生休克、肾功能衰竭、弥散性血管内凝血等严重症状。通常须重新鉴定献血者及受血者的红细胞ABO血型，并重做交叉配血试验;输血后6h左右检查患者血清胆红素、血浆游离血红蛋白含量、血浆结合珠蛋白、高铁血红蛋白均有增加，而外周血红蛋白下降;将输血前和输血后受血者的血样进行直接抗球蛋白试验可排除溶血性输血反应。另外，尚须排除药物反应、输液反应或与输血无关的其它因素所致的炎症反应。