包括梗阻性黄疸，如总胆管结石、总胆管瘤、胰头及胆管狭窄等，主要鉴别方法为胆道造影。应与下列疾病鉴别：

　　1.慢性活动性肝炎

　　凡抗线粒体抗体阳性，伴有胆淤及组织学上有胆管异常者，应首先除外慢活肝，我国慢活肝胆淤型较PBC多见，医`学教育网搜集整理短期皮质激素治疗的效果观察有助于区别这两种病。

　　2.硬化性胆管炎

　　此病少见，主要累及大胆管，上述免疫标志物阴性，且多有细菌感染性发热，胆管系统造影可帮助鉴别。

　　3.药物引起的黄疸

　　如氯丙嗪、甲基睾丸酮、磺胺、砷制剂等。多由个体过敏引起，有服药史，在服药后数周之内发病，黄疸可持续数年，常伴血嗜酸细胞增高医`学教育网搜集整理，肝活检没有典型的PBC组织学表现。