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鼠是许多疾病的储存宿主，传播疾病的途径主要是：体外寄生虫叮咬、排泄物污染、机械携带以及直接咬人等方式。可传播鼠疫、钩端螺旋体病、肾病综合出血病、恙虫病、森林脑炎、土拉伦菌病、Q热、毒浆体病、蜱传立克次体病、类丹毒、假结核、沙门氏菌病、布鲁氏菌病、李司特菌病、炭疽、旋毛虫病、蜱传回归热、皮肤利什曼病、地方性斑疹伤害、莱姆病、乙型脑炎、狂犬病、也兔热、鼠咬热、血吸虫病和肠道传染病等35种人的疾病。有统计资料证明，有史以来死于鼠传疾病的人数，远远超过历次战争死亡人的总和。

鼠所传播的疾病中，危害最大的是鼠疫。在历史上曾发生数次世界大流行。如十四世纪的一次大流行，当时称为黑热病，死于鼠疫者亚洲约4000万人，欧洲约2500万人，约占当时欧洲人口的四分之一。解放前，鼠疫曾在我国某些地方猖獗流行，如1910年，在东北满洲里一带发生肺鼠疫，传播到齐齐哈尔、沈阳、山东、河北等地，流行7个月，死亡六、七万人。

在鼠源性疾病中，现实危害最大的当是肾综合征出血热，从50年代至80年代，发病和病死人数急剧上升，到90年代初，仍维持在较高水平。病死率虽有下降，但因发病人数多，总数不少。钩端螺旋体病具有多宿主性，其中与鼠有关者占相当大的比例，年发病人数万至十万人，不低于肾病综合征出血热。由于波动大，突然出现的强烈流行可造成很大的损失。