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很多病原体可引起脑炎、脑膜炎或脑膜脑炎，如结核杆菌、肺炎支原体、立克次体、钩端螺旋体、梅毒螺旋体、芽生菌、粗球孢子菌、荚膜菌、寄生虫、弓形体、隐球菌等。此外，一些疾病如非典型性细菌性心内膜炎、细菌性脑膜炎、脑脓肿及胶原性血管病等也可表现脑炎的症状，但是脑炎中最重要的病原体是病毒。

由病毒感染引起的脑炎称病毒性脑炎，是指由多种病毒感染引起的脑实质炎症，常表现为发热、头痛、抽畜、意识障碍和脑膜刺激症状等。医学|教育|网搜集整理并可有中枢神经系统局灶性损害，预后不佳，死亡率较高，部分存活者可出现后遗症，如30%的乙型脑炎病人可留有后遗症。病毒感染也常累及脑膜出现脑膜炎，脑膜炎可分为细菌性和无菌性两种，后者是指脑脊液涂片和细菌培养阴性的脑膜炎。由于无菌性脑膜炎多由病毒感染所致，所以无菌性脑膜炎和病毒性脑膜炎几乎成为同义词。病毒性脑膜炎的病程一般较短，预后较好。病毒性脑膜脑炎是指脑组织和脑膜同时感染。