两经病或三经病同时发生的为合病，例如太阳病伤寒证或中风证与阳明病同时出现，为“太阳阳明合病”。凡一经之病，治不彻底；或一经之证未罢，又见他经证候的，称为并病。例如太阳病发汗不彻，因而转属阳明，为太阳阳明并病。凡病邪初起不从阳经传入，而经中阴经，表现出三阴经证候的为直中。尚有里邪出表，由阴转阳的传变方式、为正气渐复，病有向愈的征象。

临床上病情变化很复杂。上述六种病证既可单独出现，亦可两种或三种合并出现。如头项强痛，恶寒发热，四肢关节微痛等太阳病证既可与阳明病的身热，口渴，下利黄色粪水，肛门灼热等里热症状同时出现，亦可在太阳病邪未尽的基础上，进而出现呕吐、胸胁苦闷等少阳病证。对于太阳与阳明合病可用葛根汤发汗解表、生津止利，而太阳与少阳并病时可用柴胡桂枝汤双解太阳与少阳。