有多种实验室检验可帮助诊断艰难梭菌相关性腹泻（CDAD）。毒素检测和培养细胞的毒素中和试验通常被认为是“金标准”。产毒素培养是检测艰难梭菌分离菌株的毒素产生情况，并具有较高的敏感性和相当的特异性。而直接粪便标本毒素中和实验，在已确诊的CDAD患者中，会有15％～38％检测不到毒素。也有一些直接粪便标本细胞毒素检测为阴性的病人，可发展为假肠膜性肠炎。如果治疗不当，一部分病人可死亡。