辅仁板蓝根具有抗菌抗病毒作用。浸液对枯草杆菌、金黄色葡萄球菌、八联球菌、大肠杆菌、伤寒杆菌、副伤 寒甲杆菌、痢疾（志贺氏、弗氏）杆菌、肠炎杆菌等都有抑制作用；丙酮浸出液也有类似作用，且对溶血性链球菌有效（皆用琼脂小孔平板法）。对a型脑膜炎球菌之抑菌作用与大蒜、金银花相似。板蓝根、大青叶抗菌、抗病毒的有效成分，有人认为是靛甙。实验证明，靛甙在体内外皆无抗菌作用；体外抗病毒作用亦不突出；在体内排泄又快，故认为它无明显生理和抗菌的活性作用。同时也具有抗钩端螺旋体作用，实验证明 1：100以上的板蓝根或大青叶，在试管内均有杀钩端螺旋体的作用。且解毒作用也很强。

副作用

大多数人都误以为板蓝根冲剂是“良性药”，多吃也不会有害。实际上，板蓝根并非没有副作用。“是药三分毒”，板蓝根也不例外。板蓝根虽然副作用较小，但服法、用量也必须严格遵照包装上的药品说明，盲目滥用起不了防病保健作用。板蓝根含多种抑菌成分，有清热解毒等功效，对感冒、流感、腮腺炎、红眼病、麻疹等春季常见病，有较好的预防和治疗作用。

板蓝根可致过敏反应：

因滥用板蓝根冲剂和针剂，发生过敏反应和其它不良反应的也不少。绝大多数为板蓝根注射液所引起 的，主要表现为头昏眼花、面唇青紫、四肢麻木、全身皮肤潮红、皮疹等，有时表现为全身出现红斑型药疹，严重时可引起过敏性休克。

用量过大损伤消化道：

板蓝根毒性极小，极少数人服用常规量会有轻度消化道症状。有报道1例4岁患腮腺炎病儿肌注板蓝根注射液的同时，口服板蓝根煎剂和含板蓝根的片剂，6天后引起上消化道出血。

板蓝根不对症反而伤身：

自发现板蓝根治疗病毒、细菌感染有效后，使用板蓝根及制剂（如冲剂、口服液）十分普遍。板蓝根属寒凉之品，虽无中毒的报道，但长期大量服用亦会有不良反应，尤其是年老体虚者。素体阳虚又过服寒凉，可出现口淡、疲乏等表现。