监督法规的压力

欧盟出台食品卫生法规第854/2004号并在这一框架下实施卫生改革，其目的是为了提高整个供应链的食品安全，并要求所有加工鱼油(包括ω-3脂肪酸)的企业获得当地监管部门的正式批准。但是，批评人士已经表示反对该卫生法规列出的时间表。这项法规将2007份作为加工企业符合卫生监督检查的最后期限。贸易团体担心，由于大多数鱼油是由欧盟以外地区的公司供应的，因此，这些供应商在遵守这项卫生法规上并无多大的经济动力。

F&S公司表示，虽然遵守法规的期限已经被延长，但是，该法规仍将是一把“达摩克利斯之剑”，因为鱼油生产商们不愿意投入巨资，以满足相关的要求。

产品标签未对成分详细阐述

含有EPA、DHA或ALA的制成品可以声称是ω-3脂肪酸的一种来源。ALA是DHA的前身，它是一种较短的长链ω-3脂肪酸，含有18个碳原子，而EPA和DHA分别含有20和22个碳原子。F&S公司表示，对消费者来说，了解他们所购买的产品是否含有EPA、DHA或ALA是至关重要的。目前，含有任何其中一种成分的食品都可以声称含有ω-3脂肪酸。

事实上，2007年11月份，在一项对各大超级市场出售的食品上张贴的ω-3脂肪酸标签所作的调查发现，许多产品使消费者产生了混淆，因为食品生产商未能针对顾客区分不同种类的ω-3脂肪酸。

管理组织

为了让消费者知道并不是所有的ω-3脂肪酸都能够带来同样的益处，包括嘉吉公司、加拿大海洋营养保健品公司和Martek生物科学公司在内的12家ω-3脂肪酸生产商合力组建了“全球EPA及DHAω-3组织”(GOED)，以解决行业所面临的问题。