卡尔·林奈最初将欧洲百合的学名描述为LiliumMartagonmontanummajus,floribusreflexis，最初是于1477年用英语记录。其种加词martagon的起源有多种说法。一种语源是名称源自奥斯曼帝国的苏丹穆罕默德一世（1413年－1421在位）佩戴的一种土耳其头巾martagan，是一种新式的伊斯兰包头巾，因为其花瓣反卷，与这种头巾类似。另一语源是名称来自战神玛尔斯的名字Mars（属格martis），因为炼金术士认为欧洲百合的形态与金属的状态变化不无关系。欧洲百合的英语俗名Martagon或Turk'scaplily都与第一种语源有关，而其德语俗名Türkenbund也是外来语，源自土耳其头巾turban。