甲硝唑用于治疗肠道和肠外阿米巴病（如阿米巴肝脓肿、胸膜阿米巴病等）。还可用于治疗阴道滴虫病、小袋虫病和皮肤利什曼病、麦地那龙线虫感染等。目前还广泛用于厌氧菌感染的治疗。

抗阿米巴及抗滴虫药，用于各种阿米巴病及滴虫病，也用于各种厌氧菌所致的败血症、心内膜炎、下呼吸道感染、腹腔内感染、妇科、中枢神经系统、骨、关节和皮肤软组织感染等。某些污染或可能污染的手术，如选择性结肠直肠手术，本品可作为术后感染的预防用药。

本品适用于阴道滴虫病、各种类型的阿米巴病。医学`教育网搜集整理治疗贾第虫病的疗效可达100％。本品还用于治疗厌氧菌感染，对热带性嗜酸粒细胞增多症、伪膜性肠炎、克隆病、麦地那龙线虫感染等也有良效。此外，本品尚可用于治疗微丝蚴感染、小袋虫病和皮肤利什曼病。