如果怀孕头3个月发生先天性感染，大约40%胎儿可能有严重的损害，出现流产、死胎或新生儿疾病，或者出生后有眼、脑或肝脏的病变或畸形，如视网膜脉络膜炎、白内障、脑内钙化、脑积水、小头畸形、智力障碍、黄疸和肝脾肿大。怀孕末3个月发生的感染，严重者不到3%。

1996年，芬兰赫尔辛基大学医院的一项弓形虫对胎儿影响的研究发现：在他们进行血清抗体检查的16733名孕妇中，只有42人是原发性感染，其中有36 人接受了螺旋霉素治疗，长期随访结果，她们的孩子中共发生4例先天性弓形虫病，2例有严重的神经系统病变，2例无临床症状。其余原发性感染孕妇所生的孩子在生长发育和智力方面与其他孕妇的孩子没有不同。