病理性闭经可分为原发性闭经与继发性闭经两类。

原发性闭经

原发性闭经指年龄超过16岁、女性第二性征已发育但月经未来潮，或年龄超过14岁尚无女性第二性征发育者；多由于遗传学原因或生殖道先天性发育异常引起，如先天性卵巢发育不全（Turner综合征）、先天性无子宫无阴道（RKH综合征）等等。

继发性闭经

曾建立正常月经，以后因某种病理性原因引起月经停止6个月及6个月以上者，或按自身原来月经周期计算，停经三个周期以上者称继发性闭经医学|教育网搜集整理。

正常月经的建立和维持有赖于下丘脑-垂体-卵巢轴的神经内分泌调节，卵巢功能正常以及靶器官子宫内膜对性激素的周期性反应，上述任何三个环节之一发生异常。就会导致月经失调、甚至闭经。