对于VRE的抗药性的出现，一般都相信是与用在家畜饲料的抗生素作为治疗病人的药物有所关联。具体来说，与万古霉素相似而用在禽畜饲料上的阿伏霉素，能维持饲料的品质及家畜的生长而风行全球。由于家畜摄取了大量的抗生素，很自然地引起肠球菌的抗药性。畜牧业者经由食用而感染了具有抗药性的肠球菌，并在医院接受万古霉素的治疗，而对万古霉素的抗药性亦由此而被发现。

由于这种原因，日本方面已禁止在饲料上添加阿伏霉素，且对食肉进行VRE的检查。