肝炎病毒感染与再生障碍性贫血的关系主要表现在肝炎后再障。病毒性肝炎早期常可引起一时性血细胞生成异常，包括白细胞、血小板减少或全血细胞减少等，一般随肝炎好转而恢复。但有少数病人可发生严重的再生障碍性贫血。

肝炎后再障又称再障-肝炎综合征，相隔时间多在半年内，好发于青壮年，男女患病比例约为4︰1。其临床表现以出血为主，其次为感染，病情严重，死亡率高。一般认为甲、乙、丙、丁型肝炎均与再障有关，但绝大多数是由丙型肝炎病毒引起的。肝炎后再障的发病机制可能和下列因素有关：

①肝炎病毒直接抑制骨髓；

②病毒导致造血干细胞染色体损害而影响其功能医学教育/网搜集整理；

③肝炎产生自身抗体损伤骨髓干细胞；

④肝脏不能提高造血所需的营养成分；

⑤或在肝炎病程中适用对骨髓有毒的药物所致。

肝炎病毒感染与再障的关系的另一种情况为再障合并肝炎，主要原因可能与输血有关。