适时的采收和正确的加工干燥方法对金荞麦显得尤为重要，正确的采收加工可获高产且质优。一般在秋冬季节地上茎叶枯萎时采挖，收时割去茎叶，将根刨出，去净泥土及泥沙，将部分健壮、无病害的根茎取出作种用,其它干燥加工入药，一般每亩产量可达250－400千克；地上部，包括茎、叶、花产量达500-900千克，也可药用。 将清理干净的金荞麦根晒干或趁鲜切片后晒干即可。干燥方法：晒干、阴干、50℃内烘干都可以，但需注意干燥时温度不宜过高，最好不要超过50℃，若超过这一温度，药材质量就会明显下降。