腧穴的主要生理功能是输注脏腑经络气血，沟通体表与体内脏腑的联系。在临床上，医生利用腧穴的功能特点，可以对疾病进行诊断和治疗。

在疾病发生时，相应的腧穴往往可出现压痛、酸楚、麻木、结节、肿胀、变色、丘疹、脱屑、凹陷等各种反应。腧穴上所出现的不同病理反应是疾病过程中脏腑经络气血失调的结果。因此，利用腧穴的病理反应特点可以帮助诊断疾病，现在常用的方法有：①扪穴诊断法，如同时压迫足三里，左穴敏感者属胃病，右穴敏感者属十二指肠病。②望穴诊断法，如望舌下静脉（金津、玉液）对人体内瘀血有意义。③耳穴望诊法，察看耳部皮肤的变色、变形、变性等。④仪器测定法，多利用穴位的导电特性诊断疾病。

腧穴的主治作用有：1.近治作用 这是所有腧穴主治作用中具有的共同特点。凡是腧穴均能治疗该穴所在部位及邻近组织、器官的疾病。2.远治作用 这是十四经腧穴主治作用的基本规律。在十四经腧穴中，尤其是十二经脉在四肢肘膝关节以下的腧穴，不仅能治疗局部病证，而且能治疗本经循行所涉及的远隔部位的组织、器官、脏腑的病证，甚至具有治疗全身疾患的作用。3.特殊作用 大量的临床实践已经证明，针刺某些腧穴，对机体的不同状态，可起着双相的良性调整作用。例如泄泻时，针刺天枢能止泻；便秘时，针刺天枢又能通便。此外，腧穴的治疗作用还具有相对的特异性，如大椎退热，至阴矫正胎位等，均是其特殊的治疗作用。

通过针灸、推拿等治疗方法刺激相应的腧穴，可以疏通经络，激发经气，调整气血运行，达到扶正祛邪的目的。刺激腧穴治疗疾病的作用不仅对局部脏腑、器官病症有效，而且对相应经脉循行路线上与该穴相距较远的脏腑、器官病症也有效果。这是腧穴的近治和远治作用。腧穴的远治作用，在十四经穴上反映尤其突出。此外，某些腧穴还有特殊的治疗作用，可专治某病，如至阴穴可矫正胎位，治疗胎位不正。