维生素B12的工业制造是通过微生物发酵法制得（Martens JH, Barg H, Warren MJ, Jahn D （2002）. "Microbial production of vitamin B12".Applied Microbiology and Biotechnology58; 275–85. doi:10.1007/s00253-001-0902-7. PMID11935176）。

Streptomyces griseus曾经多年来是维生素B12 的来源。 现在则通常是来自 Pseudomonas denitrificans和 Propionibacterium shermanii. 它们一般需要在特殊的条件下培养以增加产率。至少一家公司, 如法国的 Rhône-Poulenc, 现已并入 Sanofi-Aventis, 是使用了基因工程改造的上述菌株。

2008年全世界维生素B12的总产量据称有35吨。大多数的产品被用于动物饲料添加剂。