博落回根含血根碱（sanguinarine），白屈菜红碱（chelerythrine），原阿片碱（protopine），α-别隐品碱（α-allocryp-toPine），博落回碱（bocconine）即是白屈菜玉红碱（chelirubine），氧化血根碱（oxysanguinarine），博落回醇碱（bocconoline），去氢碎叶紫堇碱（dehydrocheilanthifoline）。

全草中含原阿片碱，原阿片碱-N-氧化物（protopine-N-oxide），α-别隐品碱，黄连碱（coptisine），小檗碱（berberine），刻叶紫堇明碱（corysamine）。果实中含血根碱，白屈菜红碱，原阿片碱，α-别隐品碱及β-别隐品碱。小果博落回地上部分含血根碱，白屈菜红碱，原阿片碱，隐品碱（cryptopine），别隐品碱（allocryptopine）和博落回碱。