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阴道毛滴虫的生活史仅有滋养体阶段而无包囊阶段。

活体呈无色透明，有折光性，体态多变，活动力强。固定染色后呈梨形，体长7～23μm，前端有一个泡状核，核上缘有5颗排列成环状的基体，由此发出5根鞭毛：4根前鞭毛，1根后鞭毛。1根轴柱，纤细透明，纵贯虫体，自后端伸出体外。

体外侧前1/2处，有一波动膜，其外缘与向后延伸的后鞭毛相连。虫体借助鞭毛摆动前进，以波动膜的波动作旋转式运动。胞质内有深染的颗粒，为该虫特有的氢化酶体（hydrogenosome）。

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