湖南省卫生厅的内设机构：

　　办公室 　　规划财务处 　　食品安全综合协调与卫生监督处 　　医政处 　　干部保健处 　　妇幼保健与社区卫生处 　　农村卫生管理处 　　合作医疗管理处 　　疾病控制处 　　卫生应急办公室（突发公共卫生事件应急指挥中心） 　　科技教育处 　　国际合作处 　　省血吸虫病防治办公室 　　人事处 　　离退休干部处（离退休人员服务管理办公室） 　　监察室卫生厅 　　直属机关党委 　　省中医药管理局