耐药、耐多药结核病的治疗极其困难，主要是缺乏新药，敏感药。随着病情的加重治疗自然愈发困难，即便当前科学地选用以二线抗结核药为主的长疗程方案，仍然有一部分病人是不能治愈的，我国十五攻关课题“耐多药结核病综合治疗的研究”在未采用手术，介入疗法的病例也只有60-70%的疗效，而药物来源无保障，经济困难或因肝、肾功能障碍治疗不顺利的耐多药结核病患者、毫无疑问其死亡危险大大增加。

由于耐药结核病病程迁延不愈，传染性增强，传染期必然延长，对健康人群造成严重威胁，特别是随着HIV/AIDS在人群中的蔓延，增加了感染结核分枝杆菌和耐药结核分枝杆菌的机会，随时存在耐药结核病在这种人群中的爆发流行的危险，加速结核病死亡进程。

由于耐药结核病难以治愈，其治疗费用大大增加，耐药结核病的治疗费用比一般结核病要高100倍，医疗负担十分沉重。同时患者流动求医的现象也比比皆是，增大耐药菌传播机会，加大传播范围，增强传播力度。导致耐药结核病波及人群更加广泛，其中青壮年占据较大比例，耐药结核病长久得不到治愈直接影响我国社会的稳定和经济的持续发展，生产受损、家庭生活受到威胁。

面对我国耐多药结核病疫情的严重程度，全方位开展耐药、耐多药结核病防治工作已迫在眉睫，如耐药、耐多药结核病控制不利，将严重威胁结核病控制规划实施，影响结核病防治终期目标和联合国千年发展目标实现。