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一是脏腑的生理和病理。

所谓脏腑，包括心、肺、脾，肝，肾等五脏，胃，胆，小肠，大肠，膀胱，三焦等六腑以及脑、髓，骨、脉、胆，女子胞等奇恒之腑。这些脏腑和奇恒之腑各有不同的生理和病理，这是藏象学说对论的重点。

二是脏腑、组织、五官九窍之间的关系。

由于人体是一个有机的整体，不仅体内的脏与脏、脏与腑，腑与腑在生理、病理上有着密切的联系，而且脏腑与体表的皮毛、肌肉、脉、骨等形体组织以及目、耳、鼻、口、舌、前后阴等五官九窍也有着不可分割的关系。

三是津液、气血、精髓的生理和病理及其与脏腑的关系。

津液、气血、精髓都是构成人体的基本物质，它们的生成和运行以及输布，必须通过不同的脏腑功能活动才能完成，而脏腑的各种功能活动，都依赖于津液、气血、精髓作为物质基础。

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