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藏象学说形成的基础，同时亦决定了藏象学说的特点：一是以五脏为中心的整体观，二是具有时空观念的结构功能模型。
1．以五脏为中心的整体观
以五脏为中心的整体观，是整体观念在藏象学说中的体现，它认为人体是一个极其复杂的有机整体，人体各组成部分之间在形态结构上不可分割，在生理功能上相互协调，在物质代谢上相互联系，在病理变化上相互影响。这种人体自身的整体性主要体现在三个方面：一是人体五脏、六腑、形体官窍通过经络的联络、气血的贯通连接作用及功能的配合隶属关系，构成五大功能系统。二是五大功能系统之间又通过五行的生克制化，相互助长和制约，维持着整体生命活动。在五大功能系统之中，五脏藏蓄精气，主持气化，居于核心地位，六腑的功能从属于五脏，奇恒之腑贮藏的精气也源于五脏。五脏功能健旺，人体其他器官活动才能正常，身体才能强壮。故《素问·脉要精微论》说：“五脏者，中之守也”；“得守则生，失守则死。”在五脏中，心又为一身之大主，在心的主导下，全身脏腑器官的功能活动才能达到协调统一。故《灵枢·口问》说：“心者，五脏六腑之主也。”三是五脏的生理活动与人的心理活动密切相关。藏象学说认为，人体的心理活动是由心主宰，而分属于五脏。《素问·宣明五气》说：“心藏神，肺藏魄，肝藏魂，脾藏意，肾藏志。”情绪变化对应于五脏，心在志为喜，肝在志为怒，脾在志为思，肺在志为忧，肾在志为恐，五脏共同维持着心理活动的正常进行。
另外，以五脏为中心的五大功能系统又与外环境相通应，主要通过五脏的功能活动，调节着体内外环境的协调平衡。
总之，藏象学说是以五脏为中心，将人体的内脏、形体诸窍和心理活动都归属于五脏，以五脏的功能活动及其相互关系来阐释人体内环境及其与外环境的协调统一。
2．具有时空观念的结构功能模型
藏象学说的构建过程，是一个由实体向功能态演化的过程。藏象学说的形成，虽然依据了一定的解剖知识，但主要是在古代哲学思想影响下，通过对生理、病理等表象及临床疗效信息的观察分析，生理、病理和诊治相互印证、推导而成。所以，中医藏象理论重在研究脏腑器官的功能活动以及结构关系，而对其形态结构的认识十分粗略，有的甚至难以确定其位、其形，更不研究脏腑器官的物质构成。如对于肝脏，中医认识到其功能为主疏泄和主藏血，并有详细的描述；从其结构关系而言，认识到肝与胆相表里，开窍于目，在体为筋，其华在爪，但甚少论及肝的形态位置，甚至从肝的功能及其与脾、肾关系的角度，反推肝的位置，出现肝位中焦与肝在下焦之争。另外，藏象学说也从“人与天地相参，与日月相应”的整体出发，强调时间与方位，其所言脏腑，即含有时间与方位观念在内。如就时间而言，肝应春，心应夏，脾应长夏，肺应秋，肾应冬；若将一日的昼夜晨昏视为一年四季，则肝应平旦，心应日中，肺应日入，肾应夜半。五脏各在其相应之时而其气相对旺盛，从而呈现出生命活动的时间节律性。就方位而言，肝应东方，其气温和而有万物初生之象；心应南方，其气炎热而有万物长势繁茂之象；脾应中央，其气湿润而有万物变化之象；肺应西方，其气凉肃而有收敛之象；肾应北方，其气寒冷而有闭藏之象。将此关系推论到人体，若以人面南定位，则如《素问·刺禁论》所说：“肝生于左，肺藏于右，心部于表，肾治于里，脾为之使。”正由于藏象学说是一种具有时空观的结构功能模型，所以，藏象学说中一个脏的功能，可能包容着解剖结构上多个器官或系统的功能，而现代医学一个脏器的功能也可能分散在多个中医脏腑之中，藏象的本质是一个以系统功能为主体的多元化实体结构。
由于历史条件的限制以及中医学整体观察和类比思辨的思维方法，决定了藏象学说具有重宏观思辨、轻微观研究，重脏腑功能、轻形态结构的特点，其对脏腑的认识，详于对生理病理现象及其与脏腑组织之间联系的观察分析，而略于对具体形态结构的细微剖析。因此，学习藏象学说，要注意科学地理解和把握其内涵，并结合临床实践不断地加以发展。
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