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1.双子叶植物根

一般均具次生构造。最外层大多为周皮，由木栓层、木栓形成层及栓内层组成。少数根类中药的次生构造不发达，无周皮而有表皮，如龙胆、威灵仙等；或为"后生表皮"，如细辛；或为"后生皮层"，如川乌。

维管束一般为无限外韧型，初生韧皮部遭受挤压而被破坏，细胞大多颓废，次生韧皮部包括筛管、伴胞、韧皮薄壁细胞、韧皮纤维等，并有韧皮射线；形成层连续成环，或束间形成层不明显；次生木质部占根的大部分，有导管、管胞、木薄壁细胞或木纤维组成，木射线较明显；初生木质部位于中央，分为几束，呈星角状，其束的数目随植物种类而不同，一般双子叶植物的束较少，为二至六束，又称二至六原型。双子叶植物根一般无髓，少数次生构造不发达的根中央为薄壁组织区域，形成明显的髓部，如龙胆、川乌等。

双子叶植物根除上述正常构造外，还可形成异常构造，主要有下列几种类型：①多环性同心环维管束，如牛膝、商陆等。次生维管柱的外围形成多轮同心环状排列的异常维管组织。②附加维管柱，在维管柱外围的薄壁组织中能产生新的附加维管柱，如何首乌。③内涵韧皮部，又称木间韧皮部，就是在次生木质部中包埋有次生韧皮部。如茄科植物华山参等。④木间木栓，在次生木质部内形成木栓带。如黄芩的老根中央可见木栓环。有的根中的木间木栓环包围一部分韧皮部和木质部，把维管柱分隔成几个束，如秦艽。

其次应注意根中有无分泌组织存在，如油室、树脂道、乳管等；有无草酸钙结晶或碳酸钙结晶。有的根含有多量淀粉粒，有的根含有菊糖。还应注意厚壁组织，如石细胞、韧皮纤维或木纤维等。

2.单子叶植物根

与双子叶植物根的显微鉴别类似，其不同点为：单子叶植物根一般均具初生构造。最外层通常为一列表皮细胞，无木栓层，有的细胞分化为根毛，细胞外壁一般无角质层。少数根的表皮细胞分裂为多层细胞，细胞壁木栓化，形成根被，如麦冬。单子叶植物根的皮层宽厚，占根的大部分，皮层通常可分为外皮层、皮层薄壁组织和内皮层。外皮层为一层排列紧密整齐的细胞；皮层细胞排列疏松；内皮层为一层细胞，排列紧密整齐，有的可见凯氏带，有的可见凯氏点。有的内皮层细胞壁全部增厚木化，少数不增厚的内皮层细胞称"通道细胞"，如麦冬。有的内皮层细胞只有外切向壁不增厚，其余壁均增厚，横切面观时，其增厚部分呈马蹄型。中柱直径较小，最外为中柱鞘，维管束为辐射型，韧皮部与木质部相间排列，呈辐射状，无形成层。髓部通常明显。

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