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①膜面积和膜两侧的浓度差。膜面积越大扩散越快；药物在脂质膜的一侧浓度越高，扩散速度也越快，到膜两侧浓度相同时扩散停止。
②药物的脂溶性。即药物的油/水分配系数，一般分配系数愈大，药物溶入脂质膜中越多，扩散就越快。但由于药物必须首先溶于体液才能抵达细胞膜，故水溶性太低也同样不利于药物通过细胞膜，所以药物在具备脂溶性的同时，仍需具有一定的水溶性才能迅速通过脂质膜。
③药物的解离度。因为除极少数极性分子的药物（如毛花苷丙）外，绝大多数药物都是弱酸性或弱碱性的非极性分子，所以药物在溶液中都以非解离型和解离型两种形式存在。只有非解离型药物因其脂溶性大，才能溶入脂质膜中，易于通过生物膜；而解离型药物因脂溶性小，则不易通过生物膜，并被限制在膜的一侧，形成所谓的离子障。因而药物的解离度是影响药物脂溶扩散的另一重要因素。
④药物的pKa及药物所在环境的pHzui终将决定药物的解离度。pKa和pH之间的关系可用Handerson-Hasselbach公式表示：
上式中，pKa是解离常数（Ka）的负对数，而Ka是指当药物解离50%时所在溶液的pH.各药物都有其固有的pKa，它是药物本身的属性，与药物是弱酸性或弱碱性的无关，如弱酸性药物的pKa可以>7，弱碱性药物的pKa也可以<7.由上式可见，当药物pKa不变时（因为是药物本身的属性，不会变化），改变溶液的pH，可明显影响药物的解离度，进而影响药物的跨膜转运。如弱酸性药物在pH偏低的一侧，解离度小，容易跨膜转运至另一侧；反之，在pH偏高的一侧，则不容易跨膜转运至另一侧。而弱碱性药物的情况正好与之相反，在pH偏高的一侧，解离度小，容易跨膜转运至另一侧；在pH偏低的一侧，解离度大，则不容易跨膜转运至另一侧，例如苯巴比妥、水杨酸等弱酸性药物中毒时，碱化尿液可使药物的重吸收减少，而增加其排泄以解毒。
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