南开大学药学院现有1个药学本科专业，15个科研实验室，1个药学实验教学中心，有药物化学、微生物与生化药学、生药学3个二级学科，此外，还有糖生物学与药物化学、药事管理学等学科。2009年获得天津市分子药物研究重点实验室。2010年获得制药工程硕士专业医学学位授予权。2011年获得药学一级学科硕士学位授予权。2011年成立药物化学生物学国家重点实验室。
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