浙江中医药大学信息技术学院设有4个教研室、一个研究室、一个校级教学实验中心、一个计算机科学与技术本科专业，2005年，计算机科学与技术专业被学校确定为校级重点专业；直属计算机系党支部被中共浙江省教育工委授予“三树一创”好班子的称号；医学信息技术教学实验中心被列为“浙江省基础课实验示范中心建设”项目；2006年度学院被评为学校先进单位；2007年学院被评为校级优秀教学单位；2007年，物理教研室、计算机专业（1）教研室被评为学校优秀示范教研室。学院现有《计算机文化基础》、医学|教育网搜集整理《计算机网络基础》、《大学物理实验》等三门校级精品课程。

信息技术学院承担了计算机科学与技术专业、全校非计算机专业的信息类课程和全校物理类课程的教学工作；同时还负责校园网管理工作。