重庆医科大学药学院学院下设药物化学、药物分析、药剂学、药理学、临床药学、药事管理学6个教研室和药学实验管理中心。学院现有药学一级学科博士后科研流动站1个；药理学博士学位授权点1个；药物化学、药物分析、药剂学、生药学、药理学、微生物与生化制药硕士学位授权点6个；药理学、药物化学为重庆市重点学科；现有药学、临床药学4个专业、专业方向。

学院现有教职工64人，其中专职教师60人，党政管理人员3人，技术人员1人。教师中具有高级职称的38人（正教授13人，副教授25人），占教师总数的63%；具有研究生学历的50人（博士生19人，硕士生31人），占教师总数的83%.博士生导师7人，硕士生导师23人；国务院政府特殊津贴专家2人，国务院学位委员会评审专家2人，医学|教育网搜集整理国家新药及食品评审专家6人。重庆市首批学术技术带头人3人，重庆市首批学术技术带头人后备人选3人；重庆市第二批学术技术带头人5人，重庆市第二批学术技术带头人后备人选3人。重庆市骨干教师2人，重庆市政府“322”重点人才工程第二层次人选2人。