中南大学湘雅医学院医药信息系的前身是原湖南医科大学医学图书情报学系，成立于1987年4月，同年秋季开始招生。1995 年6月1日更名为湖南医科大学医药信息系。1998 年10月更名为信息管理系。2000年4月，原湖南医科大学、长沙铁道学院与中南工业大学合并，组建中南大学以来，曾用名“中南大学湘雅医学院信息管理系”。医学|教育网搜集整理2002 年7月，中南大学成立医学技术与情报学院，系名便更改为“医学技术与情报学院医药信息系”。2006年3月，学校撤销医学技术与情报学院，将医药信息系划归到湘雅医学院，并更名为中南大学湘雅医学院医药信息系。现在的管理体制是：学生工作和日常党务及行政工作由湘雅医学院管理；教学、科研、研究生教育以及其他党政工作由各职能部门比照直属教学科研单位模式管理。