中医药系统生物学是清华大学中药现代化研究中心多年探索、创新研究工作的总结，系统阐述了作者在中医药系统生物学研究方面的学术思想、技术路线、方法体系及相关应用成果。全书原创性强，技术前沿，体现了以下特色：提出了适合中医药研究的中医药系统生物学研究体系；提出了创新的研究模式，即从“点一点”、“点一系统”发展到“医学教|育网搜集整理系统一系统”的模式；阐述了创新的研究策略，针对复杂系统，提出采用层次化、整合各种组学（包括化学物质组学和系统生物学）的方法和逐步优化的策略来研究“系统一系统”的相互作用；阐述了创新的研究方式，针对化学和生物的复杂系统，提出采用整体表征和局部特征相结合、定性测定和定量测定相结合、多学科先进技术的整合等研究方式；发展了创新的研究方法和技术，如化学物质组学、定量代谢组学平台技术等。