西红柿含有的番茄红素是一种抗氧化剂，可抑制某些可致癌物氧自由基，防止癌的发生。西红柿也含有谷胱甘肽，具有推迟细胞衰老，降低恶性肿瘤发病率的作用。国外研究还发现西红柿提取物有降低前列腺癌患者特异性抗原PSA的作用。

《陆川本草》一书记载西红柿具有健胃消食、治疗食欲不振的作用，这可能与含有的苹果酸、柠檬酸有关，这两种成分可刺激食欲，促进胃酸分泌，帮助消化，增强胃肠的吸收功能。消化功能较差或多食荤腥油腻食品的人，在饭后进食西红柿是有好处的。

西红柿中还含有番茄碱，动物实验证明可明显降低组织胺所致毛细血管通透性升高，具有抗炎作用。西红柿中还含有丰富的核黄素、抗坏血酸、维生素A、维生素K等，对防治牙龈出血、口腔溃疡是有好处的。