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重庆医科大学原名重庆医学院，成立于1956年，由上海第一医学院（现复旦大学上海医学院）分迁来渝组建而成。1985年更为现名。先后隶属于卫生部、四川省人民政府，现隶属于重庆市人民政府。历经五十多年的发展，重庆医科大学已成为一所具有“学士-硕士-博士-博士后”完整人才培养体系的地方重点大学。

学校占地面积279万平方米，建筑面积140.3万平方米。学校总资产50.6亿元，其中教学、科研、医疗设备总值9.83亿元，藏书132万册。

学校现设研究生学院、基础医学院、临床学院、第二临床学院、儿科学院、中医药学院、公共卫生学院、管理学院、药学院、口腔医学院和护理学院11个学院和6个系（部）、1所卫生学校。设置临床医学、临床医学（儿科医学方向）、口腔医学、医学检验等46个本科专业及专业方向；1997年经教育部批准招收临床医学7年制本硕连读学生，迄今已12届，毕业7届。

学校拥有直管附属医院4所，均为三级甲等医院，设置病床近5000余张，年门诊量554余万人次，年收治住院病人11.5万人次；附属第三医院、附属大学城医院正在筹建阶段。非直管附属医院5所，教学及实习医院15所。

学校面向全国32个省、市（自治区）及18个国家和地区招生，生源丰富。现有在校学生24808人，其中博士生382人，硕士生2497人，普通本、专科生（高职）17139人；成教本专科生4206人，留学生584人。

学校现有在职职工5228人，其中正高级专业技术人员300余人；副教授、副主任医师等副高级专业技术人员800余人。有一大批专家教授入选国家“百千万人才工程”第一、二层次人选、教育部“长江学者和创新团队发展计划”、新世纪百千万人才工程、政府特殊津贴、教育部“新世纪优秀人才支持计划”、教育部“跨世纪优秀人才”、教育部“高等学校骨干教师资助计划”等资助项目和计划。

现有国家重点学科4个，省市级重点学科29个；国家工程研究中心1个，教育部国家重点实验室2个，省部共建国家重点实验室1个，省级重点实验室15个（市科委3个、市教委6个、市卫生局6个）；有11个研究所，4个研究中心，20个研究室；有博士后科研流动站5个，其中企业博士后科研工作站2个；一级学科博士点2个、二级学科博士点26个；一级学科硕士点6个，二级学科硕士点53个；博士生导师188名。

学校先后承担了国家“六五”至“九五”科技攻关项目支撑计划国家自然科学基金重点973计划项目、863计划项目、国家杰出青年基金项目、国家新药基金项目、教育部跨世纪人才基金项目等高层次科技项目，同时还承担国际合作项目的研究。据中国科技信息研究所、信息分析中心关于2005年论文检索结果的分析报告获悉，我校在国内重要期刊发表论文排序居全国各类高校第42位。学校出版的《重庆医科大学学报》、《中华肝脏病杂志》、《临床超声医学杂志》、《儿科药学杂志》和《医学教育探索》等刊物，面向国内外公开发行。自1978年以来，获国家科技进步奖、技术发明奖及部、委、省等各级科技成果奖520项。我校研制的聚焦超声肿瘤治疗设备（超声聚焦刀）属世界首创，是我国第一台具有完全自主知识产权的大型医疗仪器，实现产业化以来，已在全国30余家大型医院投入使用，并出口英国、日本、韩国、新加坡等国家。

改革开放以来，学校先后与美、英、加、日、俄、法、德、澳、荷兰、瑞士、瑞典等国家及香港地区的大学建立了学者进修、留学、参加学术交流和科学研究等合作关系，聘请了98位来自美、日、英、法、德、加拿大、澳大利亚、瑞典、荷兰、泰国及香港地区的医学专家为我校名誉教授和客座教授。