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中药化学数据库tcmd

2015-05-08 13:46  来源:医学教育网    打印 | 收藏 |
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中药化学数据库tcmd:

拥有几千年历史的中草药,是祖先留给我们的瑰丽的医药宝藏。但是到目前为止对中草药的系统发掘和综合利用还远远没有形成规模。中草药的提取、分离、药理研究已有二百多年的历史。尤其是二十世纪三十年代以来,中草药的现代化研究空前繁荣,中外科学家们利用现代手段对各种中草药和民间用药进行提取分离、结构鉴定、生物测试和药理试验,积累了大量化学、生物学和药理学的研究资料,而且还在不断的更新和增加中。这些资料汗牛充栋、极有价值,同时又难免良莠不齐;如何对这些知识进行有效的挖掘利用,为新药的研究开发、中药的系统现代化、中药制剂的质量标准制定等等相关领域服务,对于从事和关心中国医药事业的科学家是一项极富挑战性的工作。

中科院过程工程研究所分子设计课题组周家驹等化学和药学专业的工作人员,对几十年来的相关资料进行了系统收集、整理、和分析;历时8年建立起一整套中草药化学资料的辨识和分析标准。并据此研制了中药化学数据库(TCMD 2003.1),收录中草药所含产物的化学结构、理化性质、生物和药理活性及文献来源等信息,目前已拥有化学结构9127个,中草药及相关药用植物3922种。该研究小组以其化学资料收集、辨识和分析标准对国内外最新的研究资料进行追踪整理,每年更新,保证该库提供最新、最可靠的中草药天然产物研究成果。

TCMD 2003.1较好地体现了科学性和实用性的统一:

TCMD数据库是利用MDL公司的化学信息管理系统ISIS/Base & Draw进行数据管理,在Windows环境下运行,使用者无需任何专业计算机知识,即可进行检索、浏览、和维护。化学结构数据以sketch文件(。skc)和mol文件(。mol)保存于数据库中,可以方便地以SDF文件的形式与任何目前存在的分子模拟和设计软件系统如Tripos和Accelrys进行交互联系。ISIS/Base & Draw提供的结构式查询方式,可以方便地为使用者提供直观、准确的结构信息。植物、药理、文献信息可通过交叉查询的方式获得。

采用确切的立体化学方式表达化学信息;

采用规范的格式表达化合物生物活性信息和中药的功效、适应症和药理;

采用严格的植物分类系统表达中药源植物;

TCMD 2003.1的主要功能和用途有:

对中药传统功效、有效成分、现代药理三类信息进行连接及整合,用综和方法研究中药现代化的有用工具;

是药物设计学中进行QSAR研究的丰富的数据源;

组合库的设计、化合物虚拟筛选、三维药效团的搜索等,医|学教育|网搜集整理以发现有潜力的化合物进入研究开发。由于TCMD中集中了中草药中有药理活性的化合物且其结构的多样性非常好,其筛选效率要远远高于普通的结构库。

是从中草药资源出发,开发中药新剂型产品的有用工具。

多途径的文字及数据检索功能及含立体化学的二维结构检索功能,为从事药物化学、植物化学、生药学、中药现代化研究的研究人员提供方便快捷的中草药成分、结构、以及所有已存在的研究资料信息,大大节省文献检索的时间和人员浪费。

TCMD 2003.1产品的相关内容该产品第一部分内容是从1800多篇(部)中英文书籍和研究论文中收集了9127种从中草药中分离出来的化合物信息。每种化合物下列10项数据:唯一代码、中文名称、英文名称、CAS登录号、分子式、分子量、物理化学性质 (晶体形态、熔点、沸点、旋光度等)、格式化的生物活性数据 (即药理模型实验结果,约3000种化合物有此数据)、含有该化合物的中药名单、含立体化学信息的结构式和参考文献。

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