南药北药对比：

南药：学校科研实力雄厚，2001-2006年承担纵向课题277项，其中国家科技攻关计划4项，“十五”国家科技重大专项和“863”计划44项；国家自然科学基金54项，其中重点项目3项；国家杰出青年科学基金2项，重大研究计划1项；教育部各类科技项目31项；江苏省科技厅各类科技项目65项。纵向科研到帐经费14780.15万元，横向科研到帐经费13491.91万元。获各类科技奖56项，新药证书43本，授权专利77项。在核心期刊发表论文2975篇，920篇论文被SCI、EI收录。学校承担的高水平研究课题项目数和成果转让经费数在国内医药院校中位居前列。通过高水平的科学研究，有力地促进了本科教学水平的提高。

北药：学校学术氛围浓厚，科研工作深入扎实。在药物新剂型设计与评价、创新药物的合成与筛选、中药与天然药物药效物质基础和质量标准、药物代谢和药物动力学、药理与毒理学、药物经济学等领域的研究均居国内领先水平。学校是国家中成药工程技术中心、沈阳国家新药安全性评价研究中心的重要组成单位，教育部创新药物研究与设计重点实验室1个，有4个国家中医药管理局批准的中药三级实验室，14个省市级工程技术研究中心或重点实验室。近5年来，承担各级各类科研项目330余项，获各级各类科技成果奖93项，申请发明专利264项，获得专利证书33项，获得新药证书71个，发表学术论文6000余篇，其中SCI收录论文1000余篇，出版专著、译著145部，仅2007年发表论文1451篇，SCI收录论文307篇。学校主办的《沈阳药科大学学报》和《中国药物化学杂志》现已成为国家药学类核心期刊。《亚洲社会药学》等三种国际学术期刊于2005年创刊。