广州中医药医科大学研究机构：

截至2014年，学校已建成5个国家科技部重点实验室（中心、基地）和一批省级重点实验室（研究室、中心、基地）。建成了5个综合性教学实验室和1个临床教学综合实验室。拥有科技部重点实验室和工程中心5个，部（局）级重点实验室19个（含4个合作）。4个科技部重点实验室（中心、基地），23个部省及厅级重点实验室（中心、基地）。其他校级研究机构10个。

学校下设14个院部等教学单位；其中包括与广东省中医药局合办的“广东省中医药职业学院”医学教育网|搜集整理；与学校实行统一领导管理体制的广州中医药研究院。下设4所直属附属医院和20所非直属附属医院以及合办的广州中医药大学祈福医院。