安徽中医药学院研究机构：

安徽中医药大学的重点研究中心包括：省部共建新安医学教育部重点实验室医学教育网|搜集整理，现代中药安徽省工程技术研究中心，现代中医内科应用基础与开发研究实验室，针灸基础与技术安徽省重点实验室（培育基地），现代中药安徽省重点实验室，安徽省中药研究与开发重点实验室，数字化影像技术实验室，神经生物学（针灸）实验室，免疫实验室，细胞分子生物学（脑病）实验室，慢性阻塞性肺疾病肺气虚证重点研究室，国家中医临床研究基地，现代中药安徽省重点实验室。

至2013年，安徽中医药大学有4个省级科技创新团队，24个省级以上重点实验室及工程（技术）研究中心。建立了安徽省中药材科技产业战略联盟，成功举办中医药科技创新与新安医学研究国际论坛、针灸经络50年回顾与展望国际学术研讨会等有较大影响的国际学术会议，被国家科学技术部授予“全国科技特派员工作先进集体”称号，被国家中医药管理局授予“中医药科技管理工作先进集体”称号。